Ich finde die Warnung auch etwas übertrieben. Klar kann es zu unerwünschten Auswirkungen kommen und klar kann man in einem laufenden Spiel nicht nach Lust und Laune grfs austauschen mit der Erwartung, dass man dann Problemlos den Spielstand weiterspielen kann.
Aber man erhält ja schon fast den Eindruck, als ob die Funktion ein Megahack ist und man danach mit 99 prozentiger warscheinlichkeit seine Festplatte formatieren muss. Und das ist ja nun auch nicht der Fall.

Im falle eines Szenarios kann man ja eigentlich ja auch nicht viel "kapput machen", im Sinne von man kann den Spielstand nicht weiterspielen, da man das Spiel ja noch gar nicht angefangen hat.
Soll mann beim grf hinzufügen/entfernen so viel Mist gebaut haben, dass das Szenario kaputt ist, einfach das Ursprungsszenario wieder herunterladen und man ist wieder am anfang.