Der Theorie mit der zu langsam berechneten Route widerspricht, dass dies der einzige Zug/Takt ist, bei dem es so lang dauert und dass immer Ausfahrt gestellt wird, wenn der Gegenzug exakt die gleiche Stelle erreicht hat. Irgendwann müsste der Prozessor mal mehr oder weniger Last haben und schneller oder langsamer zu einem Ergebnis kommen. Nach meiner Meinung sind auch nicht so viele Fahrzeuge im Spiel, dass man es darauf schieben könnte.
Und dann war da noch die Sache mit der Oberleitung, wo an der Signalausstattung nichts geändert wurde.

@Eddi:
Benötigen "normale", also ich nehme mal an Blocksignale, eigentlich weniger Rechenleistung in der Wegfindung (oder anderswo)? Weil das für mich der einzige Grund wäre, warum die auf Strecke vernünftiger sein sollten.
Ich persönlich baue fast nur Pfadsignale, weil mir die Signal-Grundstellung "Fahrt" der Blocksignale nicht so gut gefällt.
Hier reserviert sich übrigens ein (probeweise) an der Einfahrt gesetztes Blocksignal im CPP den kompletten Pfad in den Bahnhof.