Nein, OpenTTD bedient sich in der Standardeinstellung der Palette der Originalgraphiken, die Umstellung im NewGRF-Fenster bewirkt nur die Umrechnung der NewGRF-Palette in die Originalpalette, und nicht die Umstellung der intern benutzten Palette.

Diese Umrechnung war nötig, weil sonst Leute mit DOS-Graphiken kein Multiplayerspiel mit Windows-NewGRFs spielen konnten.

Also zusammengefaßt:
Wenn OpenTTD mit DOS-Originalgraphiken gestartet wird, schaltet "Palette ändern" von DOS[NewGRF]->DOS[intern] auf Windows[NewGRF]->DOS[intern] um.
Wenn OpenTTD mit Windows-Originalgraphiken gestartet wird, schaltet "Palette ändern" von Windows[NewGRF]->Windows[intern] auf DOS[NewGRF]->Windows[intern] um.