Am besten macht ihr es so:

Im Fahrplanfenster klickt ihr unten rechts auf "automatisch Ausfüllen". Dann fährt der Zug erstmal ganz normal ohne Fahrplan eine Runde, und dabei wird nach und nach die Tage, die er für eine Strecke oder an einer Station benötigt automatisch eingetragen. Wenn der Zug einmal eine ganze Runde gemacht hat, könnt ihr die einzelnen Werte auch noch Manuell ändern indem ihr die betreffende Zeile markiert und dann unten auf "Zeit ändern" (oder so ähnlich) klickt.

Noch mal zur erklärung, wie der Zeitplan funktioniert:
Im Fenster sollte eigentlich immer abwechselnd eine Station und eine Strecke zwischen zwei Stationen sein und dahinter jeweils eine Zahl. Diese Zahl zeigt an, wie lange der Zug für das befahren der Strecke bzw. für die be- und entladezeit am Bahnhof zur verfügung hat. Ist der Zug zu früh, wartet er einfach an der nächsten Station, bis die Zeit wieder stimmt, ist der Zug zu spät, fährt er sofort wieder los.

Screenshots kann ich leider keine liefern, bin grad auf arbeit