Danke erstmal für deine Antwort, aber du siehst das Problem gerade falsch.

Ich habe extra geschrieben, dass es einen Nutzer "openttd" gibt, mit welchem ich den Server starte. Den gibt es deshalb, weil ich es sicherheitstechnisch für sinnvoller halte. Ich editiere auch nur mit diesem Nutzer die Datei, da er auch als "Datei-Owner" gekennzeichnet ist. Wenn ich die Datei editiert habe, speicher ich diese ab.

Ich habe es auch mal kontrolliert, indem ich mich ausloggte, wieder einloggte und die Datei war genauso wie ich sie editiert hatte. Immer wenn ich aber den Server starte, wird "diff-custom" wieder zurückgesetzt. Das ärgert mich halt so und ich kann es mir nicht erklären.