Da gibt es zwei gegenläufige Effekte, die du ausgleichen möchtest:

1. Ware verliert an Wert, sobald sie in den Zug geladen wird. Wenn du zu lange belädst, macht sich das im Profit bemerkbar
2. Solange der Zug belädt, steigt die Bewertung am Bahnhof (bis zu einem bestimmten Punkt), du bekommst also mehr Waren, und damit verdienst du mehr. Sobald der Zug fort ist, sinkt die Bewertung wieder.
   

Am effektivsten ist es also, einen Zug so lange beladen zu lassen, bis der nächste am Bahnhof eintrifft, diese Wartezeit aber möglichst gering zu halten.